В советское время на месте церковно-приходской школы была организована начальная.
В 1935 году она была преобразована в семилетнюю.
В 1960 году школа называлась Семикаракорской восьмилетней школой №2.
В 1993 году школа реорганизована в Семикаракорскую неполную среднюю школу.
В 1997 – в Семикаракорскую основную общеобразовательную школу.
В августе 1997 года учреждение стало называться Семикаракорской средней школой №3.
В мае 2006 года МБОУ СОШ № 3 г. Семикаракорска получила статус «казачья».
В 2015-2016 учебном году в МБОУ СОШ № 3 – 30 классов-комплектов. Количество обучающихся - 725 человек. На сегодняшний день школа является социально-культурным объектом в микрорайоне. В ней созданы условия для организации процесса обучения, досуга и развития детей, оборудовано 20 учебных кабинетов с мультимедийными компьютерами, проекторами, интерактивными комплексами, кабинет, с системой видеоконференцсвязи; компьютерный класс; 2 лингафонных кабинета, 4 мобильных компьютерных класса, столовая, медицинский и процедурный кабинеты; спортивный зал, мини-футбольное поле. Воспитательная работа школы направлена на возрождение традиций донского казачества. В школе созданы два фольклорных ансамбля «Донцы» и «Вдохновение». Школа реализует следующие инновационные проекты: «ФГОС 2 поколения (2 ступень)», «Малый бизнес». С 2012 г. школа является инновационной площадкой по реализации пилотного проекта по здоровьесбережению «Армис», с 2015 года участвует в апробации учебника «Химия 8» Н.Е. Кузнецовой.
В ноябре 2014 года МБОУ СОШ № 3 стала лауреатом федерального конкурса «100 лучших школ России» в рамках III Всероссийского образовательного форума «Школа будущего. Проблемы и перспективы развития современной школы в России».
Директор школы. С 1996 года по настоящее время директор школы – Шибанова Валентина Никифоровна
Состав педагогических кадров. В 2015-2016 учебном году в МБОУ СОШ №3 работают 45 педагогов.
Из них высшую квалификацию имеют 17% учителей, первую квалификационную категорию - 31% педагогов.
6 педагогов награждены знаком «Почётный работник» общего образования: Шибанова В.Н., Юзефова О.А., Кирилина Л.И., Адонина Е.И., Кошкина С.В., Процевский А.В.
6 педагогов награждены грамотами Министерства образования и науки Российской Федерации: Королева О.В., Кошкина С.В., Процевский А В., Полтаракина Т.А., Гудованый О.А., Амилаева Е.В.
Победители Приоритетного национального проекта «Образование»: Кошкина С.В., Процевский А.В., Гудованый О.А., Садчикова И.И., Амилаева Е.В.
Абсолютный победитель Всероссийского конкурса «Учитель здоровья – 2015»: Кошкина С.В.
Победители и участники муниципального этапа конкурса «Учитель года»: Кошкина С.В., Щербинина Н.Н., Качура И.М., Садчикова И.И., Скрипникова И.М., Процевский А.А.
Участники областного конкурса «Учитель года»: Щербинина И.Г., Скрипникова И.М, Амилаева Е.В., Процевский А.А.
Медаль губернатора Ростовской области «За доблестный труд на благо Донского края»: Кошкина С.В.